此次的主人公依然是爱莉卡和真白，故事紧接TV，尽管成为了MEISTER OTOME，但是学分不够的艾莉卡不得不每天在加尔德罗贝学园接受补习课程。另一方面，真白也渐渐掌握了作为女王必须要做的事情，然而日复一日的平静生活没能维持多久，一颗陨石正在渐渐的逼近中……在这前所未有的危机面前各国通力合作，MEISTER OTOME也加入到了迎击陨石的作战行列之中……