2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案，记者城户真司为了调查此事，便到其中一个受害者神原耕一的家中调查，期间他发现了一个卡片盒，后来真司意外地使用卡片盒的力量变身为假面骑士龙骑，并认识了另一骑士秋山莲和神崎士郎的妹妹神崎优衣。 真司成为骑士的目的是保护人类和阻止骑士之间的战斗；相反不喜欢战斗的莲为了救爱人，而被迫与其他骑士战斗。随着其他骑士的出现 ，骑士的战斗渐渐变得激烈，即使真司拼命阻止，但战斗的牺牲者仍在陆续出现。