虽然先前日子在其他次元,有邪恶组织对爆丸世界的创始生命的觊觎夺取,但在爆丸战士的守卫之下,并未对爆丸世界造成影响,再次让爆丸世界回归应有和平。时间来到一年后,爆丸Inter-space的发展急速澎涨,爆丸对战亦出现了完善的联赛赛制。而在比赛中,独角巨龙屡次力量失控、当中衍生出来的暗黑爆丸的出现和大肆破坏,令小弹心理压力不断上升,其后更退出赛场,使爆丸战士间的友情受到重大考验。在此同时,有一支被称作"浑沌军团(Chaos Army)"的神秘参赛队伍,对爆丸战士与其他参赛者发动迅雷不及掩耳的震撼打击,促使爆丸战士与其他参赛者团结一致,立..